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Feature #1590

Feature #1509: Export quadrige

Traduction des informations en codes SANDRE

Ajouté par Jonathan Schaeffer il y a 7 mois. Mis à jour il y a environ 2 mois.

Statut:
Fermé
Priorité:
Urgent
Assigné à:
Version cible:
Début:
18/04/2017
Echéance:
% réalisé:

100%

Temps estimé:

Description

Mettre en place un système de traduction des objets, via la base de donnée.

export-10_20170615-1745.zip (42,9 ko) export-10_20170615-1745.zip Jonathan Schaeffer, 16/06/2017 12:29

Révisions associées

Révision cf69e75f (diff)
Ajouté par Redmine Admin il y a 7 mois

Progrès sur l'import des données

ref #1590

Révision 58ba0d36 (diff)
Ajouté par Redmine Admin il y a 5 mois

Export Sandre fonctionnel !

Reste à valider avec Marion

ref #1590

Révision f2957fa3 (diff)
Ajouté par Redmine Admin il y a 4 mois

Corrections de l'export suite à des tests

ref #1590

Historique

#2 Mis à jour par Jonathan Schaeffer il y a 5 mois

Voici le retour sur l'exemple de test envoyé à Rémi :

  • le fichier ne doit comporter aucune ligne vide (absence d'information dans la totalité des champs pour une même ligne)
  • les colonnes doivent avoir une en-tête avec un libellé correspondant exactement aux formats Quadrilabo
  • il doit impérativement y avoir un résultat, soit dans la colonne AC "résultat numérique", soit dans la colonne AD "résultat qualtitatif"
  • du coup, les lignes comportant uniquement dans le champ commentaires l'information "données perdues" ne pourront être intégrées via Quadrilabo -> il faudra les saisir via l'appli Q2
  • je dois finaliser (cet AM ???) le transcodage au format SANDRE du référentiel taxinomique MARBEN : pour rappel, nous avions convenu que les taxons MARBEN intitulés "sp1", "sp2", "spA", "spB" etc... soient intégrés sur le code SANDRE du taxon père, mais que l'on retrouve l'information sur le taxon initialement identifié çàd par exemple "Sabellidae sp1" dans la colonne "commentaires"
  • pour un même code SANDRE de lieu, j'ai des mnémoniques de passages associés qui laissent à penser que ce sont en fait 3 lieux différents qui sont échantillonnés : c'est peut être normal mais je préfère m'en assurer
  • @Marion : il faudra avant intégration créer au préalable les campagnes correspondantes dans l'appli Q2, et reprendre dans le fichier Quadrilabo les libellés exacts de ces campagnes
  • il existe un outil sur le site de la cellule Quadrige pour tester "à blanc" l'intégration au format Quadrilabo : http://wwz.ifremer.fr/quadrige2_support/Mes-donnees/J-integre-mes-donnees-a-l-aide-de-Quadrilabo/Je-teste-la-conformite-de-mon-fichier-Quadrilabo
  • pour une même ligne de résultat, les codes SANDRE du quadruplet "paramètre/support/fraction/méthode" doivent nécessairement être remplis pour autoriser l'intégration du résultat
  • la colonne GROUPE_TAXON_RESULTAT doit être systématiquement vide dans la mesure où la colonne TAXON_RESULTAT est renseignée, par contre il est possible d'ajouter une colonne avec le libellé du taxon si c'est utile pour toi

#3 Mis à jour par Jonathan Schaeffer il y a 5 mois

Voici le résultat du test d'import

#4 Mis à jour par Jonathan Schaeffer il y a 4 mois

  • Priorité changé de Haut à Urgent
  • Statut changé de Nouveau à In Progress

#5 Mis à jour par Jonathan Schaeffer il y a 4 mois

Corrections à apporter :

le fichier ne doit comporter aucune ligne vide (absence d'information dans la totalité des champs pour une même ligne)
les colonnes doivent avoir une en-tête avec un libellé correspondant exactement aux formats Quadrilabo
il doit impérativement y avoir un résultat, soit dans la colonne AC "résultat numérique", soit dans la colonne AD "résultat qualtitatif"
du coup, les lignes comportant uniquement dans le champ commentaires l'information "données perdues" ne pourront être intégrées via Quadrilabo -> il faudra les saisir via l'appli Q2
je dois finaliser (cet AM ???) le transcodage au format SANDRE du référentiel taxinomique MARBEN : pour rappel, nous avions convenu que les taxons MARBEN intitulés "sp1", "sp2", "spA", "spB" etc... soient intégrés sur le code SANDRE du taxon père, mais que l'on retrouve l'information sur le taxon initialement identifié çàd par exemple "Sabellidae sp1" dans la colonne "commentaires"
pour un même code SANDRE de lieu, j'ai des mnémoniques de passages associés qui laissent à penser que ce sont en fait 3 lieux différents qui sont échantillonnés : c'est peut être normal mais je préfère m'en assurer
@Marion : il faudra avant intégration créer au préalable les campagnes correspondantes dans l'appli Q2, et reprendre dans le fichier Quadrilabo les libellés exacts de ces campagnes
il existe un outil sur le site de la cellule Quadrige pour tester "à blanc" l'intégration au format Quadrilabo : http://wwz.ifremer.fr/quadrige2_support/Mes-donnees/J-integre-mes-donnees-a-l-aide-de-Quadrilabo/Je-teste-la-conformite-de-mon-fichier-Quadrilabo
pour une même ligne de résultat, les codes SANDRE du quadruplet "paramètre/support/fraction/méthode" doivent nécessairement être remplis pour autoriser l'intégration du résultat
la colonne GROUPE_TAXON_RESULTAT doit être systématiquement vide dans la mesure où la colonne TAXON_RESULTAT est renseignée, par contre il est possible d'ajouter une colonne avec le libellé du taxon si c'est utile pour toi
....

#6 Mis à jour par Jonathan Schaeffer il y a 4 mois

  • % réalisé changé de 0 à 100
  • Statut changé de In Progress à Résolu

Les corrections ont été apportées. On a maintenant un export quasiment fonctionnel.

En attente de validation par l'équipe quadrilabo

#7 Mis à jour par Marion Maguer il y a environ 2 mois

  • Statut changé de Résolu à Fermé

Formats disponibles : Atom PDF